序列翻译与ORF预测
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刘庆坡
目录
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第1讲 生物信息学的概念及其发展历史
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● 生物信息学的发展历史
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● 生物信息学的研究领域
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● 生物信息学的主要应用
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● 生物信息学面临的挑战
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第2讲 生物学基础
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● 生物的分类
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● 核酸
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● 蛋白质
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● 染色体和基因
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● 中心法则
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● 基因编辑简介
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第3讲 生物学数据库及其检索
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● 生物学数据库简介
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● 生物学数据库的内容与结构
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● 生物学数据库的检索
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第4讲 序列比对原理
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● 序列比对相关概念
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● 序列比对打分方法
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● 序列比对算法
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● 序列比对工具
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● 多序列比对
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第5讲 基因结构预测与核酸序列分析
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● DNA序列分析的意义
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● 基因结构
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● 序列翻译与ORF预测
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● 核酸序列分析框架
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● 基因识别的两种途径
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● 数据库搜索
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● 生物信息学软件
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● 新测定DNA序列的分析实例
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第6讲 蛋白质结构预测与分析
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● 蛋白质结构组织层次
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● 蛋白质结构的测定与理论预测
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● 蛋白质对接
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● 蛋白质折叠与疾病
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第7讲 分子进化与系统发育
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● 分子进化与系统发育
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● 分子系统发育树的构建方法
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● 系统发育树构建及应用
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第8讲 基因组信息学
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● 基因组序列信息分析工具
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● 人类基因组信息数据库
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● 生物信息学在基因组研究中的应用
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● 后基因组计划
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● 基因组信息学的研究进展
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第9讲 新一代测序技术及其应用
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● 测序技术概述
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● 第二代和第三代测序原理
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● 第二代和第三代测序技术的应用
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● 生物信息学在新一代测序中的应用
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